[1]陈旭,徐燕梅,张露萍,等.非小细胞肺癌放疗敏感性miRNAs的生物信息学筛选[J].中华肺部疾病杂志,2016,(02):0.
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非小细胞肺癌放疗敏感性miRNAs的生物信息学筛选(PDF)
《中华肺部疾病杂志》[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]
- 卷:
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- 期数:
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2016年02期
- 页码:
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0
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- 出版日期:
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2016-04-28
文章信息/Info
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- 作者:
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陈旭; 徐燕梅; 张露萍; 李德志; 孙建国
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- Author(s):
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- 关键词:
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非小细胞肺癌; 基因芯片; 生物信息学; 放疗敏感性; miRNAs
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- 分类号:
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- DOI:
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- 摘要:
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目的 利用基因芯片及生物信息学方法预测与非小细胞肺癌(NSCLC)放疗敏感性相关的miRNAs。 方法 检索GEO数据库,获取H460、H1299细胞株经2Gy电离辐射后随时间变化的基因表达谱,经组织特异性分析、功能富集(GO)分析、信号转导通路(Pathway)分析、miRNAs预测分析、转录因子(TF)分析,并建立mRNAmiRNATF网络,获取NSCLC放疗敏感性相关的miRNAs。结果 获得了NSCLC放疗敏感性基因表达谱,辐射抵抗潜在基因共23个,辐射敏感潜在基因共97个;与放疗敏感性相关的miRNAs共19个,其中调控辐射抵抗组的miRNAs共14个:hsa-miR-1-3p、hsa-miR-1297、hsa-miR-153-3p、hsa-miR193a3p、hsa-miR-206、hsa-miR-302e、hsa-miR-328-3p、hsa-miR-372-3p、hsa-miR-495-3p、hsa-miR-520a-3p、hsa-miR-520b、hsa-miR-520d-3p、hsa-miR-520e、hsa-miR-613;调控辐射敏感组的miRNAs共5个:hsa-let-7c-5p、hsa-miR-137、hsa-miR-203a-3p、hsa-miR-34c-5p、hsa-miR-98-5p。结论 利用生物信息学方法初步筛选到与非小细胞肺癌放疗敏感性相关的miRNAs。
- Abstract:
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更新日期/Last Update:
2016-04-28