[1]张韶岩,曾小莉,郭琳,等.非小细胞肺癌环状RNA表达谱的差异分析[J].中华肺部疾病杂志,2018,(02):0.
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《中华肺部疾病杂志》[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]
- 卷:
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- 期数:
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2018年02期
- 页码:
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0
- 栏目:
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- 出版日期:
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2018-04-20
文章信息/Info
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- 作者:
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张韶岩; 曾小莉; 郭琳; 区颂雷; 马旭晨
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- Author(s):
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- 关键词:
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非小细胞肺癌; 环状RNA; 环状RNA芯片
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- 分类号:
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- DOI:
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- 摘要:
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目的 探讨环状RNA(circularRNA,circRNA)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化,并分析二者的差异。方法 应用高通量circRNA芯片技术筛选3例患者NSCLC癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱的差异,经过对原始数据进行预处理、归一化后,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行聚类分析和生物信息学预测。结果 芯片检测结果显示circRNA在以上组织标本中表达分布几乎是相同的;层次聚类分析、散点图和火山图结果显示差异表达的circRNA能将NSCLC癌组织与癌旁组织明显区分开来。NSCLC癌组织与癌旁组织之间存在171种circRNA 的差异表达,其中在肿瘤组织中高表达的有148种,低表达的有23种(变化>2倍且P<0.05)。应用TargetScan和miRanda软件预测出每种差异circRNA结合匹配值较高的5个微小RNA(microRNA, miRNA),提示包括miR-21、miR-22、miR-29、miR-129、miR-143、miR-150和miR-200等均为在NSCLC发生发展中起着重要调控作用的miRNA。 结论 NSCLC癌组织与对应癌旁组织比较,circRNA表达谱发生了显著变化,这些差异表达的circRNA可能与非小细胞肺癌的发生发展密切相关。
- Abstract:
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更新日期/Last Update:
2018-04-20